Pelaksanaan KSM dari tahun ke tahun ke tahun mulai membaik melalui aplikasi KSM yang dikelola panitia pusat dengan moda daring pemantauannya pun lebih ketat karena pelaksanaan dipantau dengan kamera laptop. KSM Kabupaten tingkat Madrasah Aliyah dilaksanakan hari Sabtu tanggal 13 Agustus 2012 yang di diikuti 6 Madrasah yang di pusatkan di satu titik yaitu di MAN Bengkulu Selatan yang dihadiri pengawas kemenag dan dari bidang Madrasah yang stand by mengawal KSM Kabupaten dari pagi sampai usai.
Madrasah Aliyah Makrifatul Ilmi mengikuti KSM seluruh mapel yaitu:
Mapel Matematika terintegrasi diwakili olehFadly Jorgiawan Pratama dan Mufidah Jihan
Mapel Biologi terintegrasi dikuti oleh Mutiara Nurhasanah dan Nadia Faridatul Hasanah
Mapel Fisika diikuti oleh Ahmad Fathoni Najib
Mapel kimia Terintegrasi diikuti oleh Lovita Juliusna Putri dan Azizah Putri Ramadhania
Mapel Geografi diikuti oleh Alfatihah qusnul Khotimah dan Dina Fitria Erwanda
Mapel Ekonomi dikuti oleh Fauziah dan Robiatul Adawiyah.
Pelaksanaan KSM Kabupaten dibagi 3 sesi adapun sesi 1 jam 07.30 – 09.30 mapel matematika terintegrasi dan biologi terintegrasi, Sesi 2 jam 10.00 – 12.00 wib mata pelajaran fisika Terintegrasi dan Kimia Terintegrasi dan yang sesi terakhir jam 12.30 – 14.30 mata pelajaran geografi terintegrasi dan ekonomi terintegrasi.
Pelaksanaan KSM berjalan dengan lancar sesuai dengan jadwal yang telah di tentukan dan santri MA Makrifatul Ilmi Alhamdulillah masih dalam kondisi sehat segar , tering doa memohon pinta agar 11 santri Makrifatul Ilmi semuanya mewakili kabupaten ke KSM Provinsi.